MiSeq系统是Illumina公司于2011年2月推出的新核酸序列测序设备。2012年10月新升级后的通量为每次反应7.5-8.5G数据。测序读长可以达到2*250bp。数据质量堪与高端的HiSeq2000相媲美。该仪器覆盖了之前未曾覆盖的低通量市场。

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该仪器用于液相色谱中具有紫外吸收物质（蛋白、核酸、多肽酶）的检出仪器，该仪器与层析柱，恒流泵等部分收集仪器和电脑记录仪配套，可组成一套完整的液相色谱分离分析装置。

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MiSeq是目前唯一一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪，每次运行能产生超过1 Gb的数据。MiSeq有着革命性的流程和无可比拟的准确性，这让它成为快速且经济高效的遗传分析的理想平台，适合广泛的应用。

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Discover Hydrolysis是一个专用来控制酸水解的微波仪器。

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